新海研3號的主要運作經費來自教育部，每年均匯整執行成果繳交補助單位，各年度的成果報告如下：

• 112年績效型補助經費執行成果報告：Link
• 111年績效型補助經費執行成果報告：Link
• 110年績效型補助經費執行成果報告：Link